3 Flotylla Okrętów to główna siła uderzeniowa Marynarki Wojennej: okręty podwodne, okręty bojowe i nadbrzeżne rakiety NSM. Jej okręty regularnie wchodzą w skład stałych zespołów NATO.21
Skład
Z okazji 55-lecia (11 marca 2026) Gazeta Morska wyliczała 14 podległych jednostek: dywizjon okrętów bojowych (dwie fregaty typu Oliver Hazard Perry, trzy okręty rakietowe typu Orkan i korwety), dywizjon okrętów podwodnych (jeden okręt typu Kilo), dywizjon okrętów wsparcia (Piast, Lech, Wodnik, Maćko, Zbyszko), dywizjon hydrograficzny, grupę okrętów rozpoznawczych, Morską Jednostkę Rakietową, 9 dywizjon przeciwlotniczy, 43 batalion saperów MW i Komendę Portu Wojennego Gdynia; pod flotyllę podlega też Okręt-Muzeum ORP „Błyskawica”.32
Poza Gdynią jednostki flotylli stacjonują na Helu, w Siemirowicach i w Ustce. Gazeta Morska podaje, że służy w niej blisko 3 tys. marynarzy i pracowników, Defence24 – ponad 3000 marynarzy.13
NATO i przyszłość
Flotylla wydziela okręty do Sił Odpowiedzi NATO i stałych zespołów Sojuszu. Jej przyszłość to fregaty Miecznik i okręty podwodne Orka.13